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再拓新應用！序禎達完成基於DNBSEQ-T7平臺的Olink Explore適配...
2024-06-05 18:46
近日，上海序禎達生物科技有限公司（以下簡稱：序禎達生物）實驗室在華大智造DNBSEQ-T7平臺上完成了Olink Explore HT產品的適配驗證，實驗及測序后的數據經過Olink Proteomics（以下簡稱：Olink）官方驗證，得到了100%樣本通過QC的好成績，標誌着Olink蛋白組學與DNBSEQ平臺兼容取得了新進展，也意味着DNBSEQ-T7平臺成功拓展蛋白組學應用。通過序禎達生物、Olink、華大智造三方的合作，為終端用户帶來了更多的選擇和更好的使用體驗。
圖1. Olink Explore HT檢測實驗流程圖 （測序平臺：DNBSEQ-T7） 驗證內容本次驗證採用了66例健康男性及66例健康女性的血漿樣本，通過Explore HT標準實驗流程進行了實驗並完成了文庫構建，使用MGIEasy Olink文庫環化套裝將文庫環化后上機DNBSEQ-T7平臺進行測序（測序策略：SE66，測序時間約5小時），同時在其原有測序平臺上機測序，通過比較NPX值的分佈情況對不同平臺的產出效果進行對比，結果如下：
圖2. 不同測序平臺NPX值分佈的對比Olink Explore HT文庫在DNBSEQ-T7與原有平臺的NPX值分析對比結果顯示兩個平臺的結果具有極高的一致性。
此外，驗證還選擇了12例已知的在性別間顯著差異表達的蛋白來驗證DNBSEQ-T7平臺產出的結果。其中包括了一些在生殖發育中承擔重要作用的蛋白, 如INSL3、EDDM3B 和 TEX101。結果發現這12種蛋白的濃度在男女樣本的濃度均與經驗結果一致，同時在DNBSEQ-T7及原有平臺上檢測這些蛋白時獲得了高度一致的結果（如下圖）。 圖3. 部分男女間差異蛋白在DNBSEQ-T7的NPX值以及不同平臺的檢測結果比較關於三方合作的
序禎達生物Olink蛋白組學平臺
從2021年序禎達生物與Olink建立合作伙伴關係，併成為Olink在中國的首批合作實驗室之一，序禎達生物開始採用Olink專有的鄰位延伸分析技術（Proximity Extension Assay, PEA），賦能端對端的多組學臨牀研究，以加速中國精準醫學發展進程。2023年，序禎達生物與華大智造簽署了戰略合作協議，拓展了原有測序模式的可及性。 序禎達生物也是國內首家可提供Olink Explore、Target、Flex及Focus全系列產品的服務商，是國內首家通過Olink Target 48/96和Olink Explore質控標準的一致性驗證的服務商，一直以來致力於提供滿足國際標準的高質量的檢測數據和服務。在Olink項目經驗方面，已成功滿足超過23種樣本的檢測服務，Olink Explore平臺檢測樣本數也已達數萬例，無論是檢測經驗還是交付質量，均處於國內領先地位。 序禎達生物創始人兼首席執行官孫樂樂博士表示：「序禎達生物是一家專業提供測序技術服務和多組學研究解決方案的服務型平臺企業，多年來一直追求卓越的質量控制標準，擁有多臺高通量測序儀，在測序服務方面一直走在行業前列。序禎達生物也是Olink國內首家服務商，2022年成為首家通過Olink Target 48/96和Olink Explore一致性驗證的中國服務商，今年年初，又率先通過了Olink Explore HT檢測的國內外實驗室一致性驗證評估且獲得了國內首家官方認證，是Olink國內的具備國際質量的服務商。很榮幸在序禎達生物的平臺可以見證Olink Explore數據能在華大智造的DNBSEQ-T7上產出且通過官方的QC認證，未來，多組學、測序將有更多的可能性，讓我們共同期待。」華大智造副總裁、中國區總經理彭歡歡表示：「此前，我們對DNBSEQ-T7的性能進行了全面升級，通量更高、速度更快、數據質量更佳，全方位賦能多組學研究發展。此次適配，將助力序禎達生物為其客户提供更優質、更高效、更專業的技術檢測服務，為蛋白組技術及應用的發展注入強大動力。」
關於Olink及Olink Explore
Olink Proteomics創立於瑞典烏普薩拉，致力於突破蛋白檢測在「多重能力/特異性」、「靈敏度」和「檢測通量」等方面的綜合瓶頸，進而實現超靈敏多重蛋白標誌物檢測、無偏靶向蛋白質組學和精準蛋白組學，以幫助蛋白標誌物的發現、藥物研發、轉化醫學、以及讓「多組學整合」真正切實可行。Olink現已覆蓋100%主要信號通路，實現生物學意義上的超靈敏無偏靶向蛋白組學（兼容各種樣本類型，對傳統方法無法勝任的血漿血清等體液樣本尤其適用）。Olink Explore產品通過發現新穎且具有生物學相關性的蛋白生物標誌物，以賦能基因組學研究擴展。Explore系列產品一直處於多靶點蛋白組學檢測的前沿，通過與測序平臺結合而具有超高的特異性和高通量能力。該前沿方法通過一對寡核苷酸獨特標記的抗體對靶向蛋白識別結合，以在最小樣本需求下，保證蛋白丰度測量中的高特異性和高靈敏度。Explore HT 新品進一步擴展了Explore的功能，可高通量完成在172個樣本上同時檢測超過 5,400 種蛋白。其檢測範圍已100%覆蓋了反應途徑（Reactome）中所有頂層通路，為廣泛而深入蛋白組研究提供了基礎。
·(華大智造)
